Erscheinungsjahr 2012
Länge 94 Minuten
Altersfreigabe FSK 6
Budget 110 Millionen USD
Hank Parsons hilft seinem Stiefsohn Sean Anderson dabei, eine verschlüsselte Nachricht zu entschlüsseln, von der Sean glaubt, dass sie von seinem Großvater stammt, den er verloren hat. Sie kommen zu der Erkenntnis, dass der Code mit den Büchern Die Schatzinsel, Gullivers Reisen und Jules Vernes Die geheimnisvolle Insel zu tun hat.
Die Reise zu der geheimnisvollen Insel beginnt, als Sean feststellt, dass alle Bücher, die er gelesen hat, auf derselben Insel spielen. Er sieht sich daraufhin die Karten in den Büchern an und bestimmt die Koordinaten der Insel. Sean und Hank reisen nach Palau und treffen Gabato und seine Tochter Kailani. Sie fliegen sie zu ihrem Ziel, aber der Hubschrauber gerät in einen Sturm und stürzt auf der Insel ab.
Als die Gruppe die Insel erkundet, stellen sie fest, dass alle Tiere entweder sehr klein oder sehr groß sind. Dann werden sie von einer riesigen Eidechse angegriffen, aber sie werden von Alexander gerettet. Er nimmt sie mit in seine Hütte, die er aus den Überresten des Schiffes gebaut hat, mit dem er gekommen ist.
Kailani versucht verzweifelt, einen Weg zu finden, das Festland zu kontaktieren, aber Alexander sagt ihr, dass das erst in zwei Wochen möglich sein wird. Am nächsten Tag nimmt er die Gruppe mit zur verlorenen Stadt Atlantis. Er erklärt, dass die Insel alle 140 Jahre versinkt und sie noch etwas Zeit haben, bevor es wieder passiert.
Hank glaubt, dass Alexanders Vorhersagen ungenau sind, denn es gibt Anzeichen dafür, dass die Insel in den nächsten Tagen sinken wird. Die einzige Möglichkeit zu entkommen besteht darin, Kapitän Nemos U-Boot Nautilus zu finden, das irgendwo auf der Insel versteckt ist. Kailani entdeckt Nemos Tagebuch, in dem der Standort des Schiffes verzeichnet ist, und sie machen sich auf die Suche. Unterwegs kommen sie an einem goldenen Vulkan vorbei, den Sean erforschen möchte, aber sie haben keine Zeit und müssen weiter zur Höhle fahren.
Die Gruppe überquert einen Berg auf riesigen Bienen, als sie von Vögeln angegriffen werden. Sean und Kailani können sich retten, aber Kailani stürzt dabei von der Biene. Sean gelingt es, sie zu retten und Kailani ist ihm dankbar. Aber die Gruppe wird immer noch von den Vögeln gejagt und Sean stürzt und verrenkt sich den Fuß, was die Gruppe erheblich verlangsamt.
Am nächsten Morgen stellt die Gruppe schockiert fest, dass das Wasser deutlich angestiegen ist. Hank glaubt, dass ihnen nur noch ein paar Stunden bleiben, bevor die Insel vollständig unter Wasser steht. Sean und Hank machen sich auf den Weg zur Küste, während Kailani und Alexander nach Gabato suchen. Schließlich treffen sie sich alle wieder an der Küste, aber die Höhle ist bereits unter Wasser.
Nachdem sie die Nautilus entdeckt haben, stellt die Gruppe fest, dass sie Druckluftflaschen brauchen, um sie erforschen zu können. Sie bauen diese Flaschen aus Plastiktüten und tauchen hinunter zum U-Boot. Auf ihrer Reise werden sie jedoch von einem riesigen Zitteraal angegriffen. Glücklicherweise schaffen sie es rechtzeitig zurück zur Nautilus und starten das U-Boot. Obwohl die Batterien alt sind, können sie das U-Boot immer noch antreiben allerdings benötigten sie dank Hanks Idee Starthilfe von dem riesiegen Zitteraal.
Kailani und Alexander sind auf der Suche nach Gabato, der zum Goldvulkan gegangen ist. Sie finden ihn dort, wo er nach Gold gräbt, damit er seiner Tochter ein besseres Leben bieten kann. Kailani gelingt es, ihren Vater davon zu überzeugen, dass sie schnell zurück an die Küste müssen.
Nachdem sie angekommen sind, stellen Sean und Hank fest, dass es kein U-Boot gibt und dass die Insel sinkt. Die drei werden unter Wasser gezogen, aber Sean und Hank gelingt es, das U-Boot zu starten und sie an Bord zubringen. An Bord muss Gabato das Ruder übernehmen, da die sinkende Insel den Weg zum Pazifik versperrt. Hank feuert einen Torpedo ab.
Sechs Monate später besucht Kailani Sean an seinem Geburtstag. Sie telefoniert mit ihrem Vater, dem es dank der Popularität von Kapitän Nemos U-Boot, der Nautilus, die in Palau zu einer großen Touristenattraktion geworden ist, finanziell gut geht. Auch Seans Großvater kommt zu seinem Geburtstag.